- Bureau ministériel
- Coordination générale (CG)
- Cellule d’experts dépendants de la Coordination générale
- Bureau central
- Relations publiques
- D1 - Direction du Climat, du Développement Durable et de l’Économie Circulaire
- D2 - Direction des Ressources Naturelles, de l’Eau et des Forêts
- D3 - Direction des Évaluations des Incidences sur l’environnement
- D4 - Direction des Affaires Juridiques
- D5 - Direction des Affaires Européennes et Internationales
- D6 - Directions des Finances, des Ressources Humaines et de l’Informatique
- Administration de l'environnement
- Administration de la nature et des forêts
- Administration de la gestion de l'eau
